> Часто её ругают за то, что названия файлов с паролями хранятся в открытом виде (а они обычно представляют собой названия сайтов на которых вы зарегистрированы). Но лично мне нравится настолько простой формат хранения паролей.

Существует расширение, которое позволяет хранить дерево сайтов в "гробнице" - https://github.com/roddhjav/pass-tomb#readme

---

А ещё есть расширение, которое позволяет использовать pass для двухфакторного входа - OTP (правда, смысл двухфакторки теряется) - https://github.com/tadfisher/pass-otp#readme
У яндекса тоже есть OTP, но у них свой - YAOTP - с дополнительным ключом - пин-кодом. Для него использую https://github.com/tujh2/yaGotp

Для себя я писал отдельный скрипт, который работает как клиент только для чтения хранилища pass. Одной командой он копирует пароль, а другой командой парсит и копирует поле "login: blabla" или "email: gg@gg.ru", если не найдено первое.